全世界有超過 3500 萬人感染了這種病毒，每年有近 200 萬新病例，艾滋病毒仍然是一種主要的全球流行病。雖然抗逆轉錄病毒療法 (ART) 可以控制感染，但受 HIV 感染的休眠免疫細胞會持續(xù)存在于全身的某些組織中，如果 ART 被中斷，它們會重新發(fā)揮作用。這種潛伏的病毒庫是開發(fā) HIV 治愈方法的主要挑戰(zhàn)。
為了更好地了解 HIV 持續(xù)存在的機制和病理學，研究人員，包括 BIDMC 病毒學和疫苗研究中心的首席研究員 Sizun Jiang 博士，開發(fā)了一種新方法，使團隊能夠表征病毒庫和免疫與未感染的對照組織相比，感染 SIV(一種相關病毒)的組織內(nèi)的反應。這樣做揭示了受感染和未感染組織之間的差異，這使科學家們能夠提出一個模型來說明 SIV 感染抑制免疫反應的機制。
“目前研究病毒組織庫的方法通常需要將細胞從其原生組織環(huán)境中取出，”主要作者江說，他在斯坦福大學開始這項工作并在 BIDMC 完成了這項工作。“我們的技術使我們能夠原位表征蛋白質(zhì)分子，這對于開展病毒感染及其他方面的研究至關重要。”
結合其他成像技術，該團隊使用 PANINI(蛋白質(zhì)和核酸原位成像)，它利用抗體來量化組織隔間內(nèi)的 DNA、RNA 和蛋白質(zhì)水平，以測量來自健康或 SIV 的檔案淋巴組織中的 30 多種組織特征。感染的非人類靈長類動物。該技術有助于揭示組織微環(huán)境中的 11 個不同區(qū)域或細胞鄰域。當研究人員比較健康組織和受感染組織之間的這些鄰域時，這些差異證實了逆轉錄病毒感染的眾所周知的特征，并使科學家們能夠開發(fā)一種機器學習模型來預測病毒激活。
“基本問題仍然存在，未來的原位工作對于提高我們對病毒感染及其他方面的理解至關重要，”江說。“我們預計 PANINI 與其他廣泛采用的成像策略相結合，代表了向前邁出的一大步，以推進更好地指導治療干預策略所需的洞察力。”
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