人類 ALS 骨骼肌的轉錄組學分析揭示了 circRNA 失調的疾病特異性模式

一篇新的研究論文發(fā)表在Aging雜志上，題為“人類 ALS 骨骼肌的轉錄組學分析揭示了異常調節(jié)的 circRNA 的疾病特異性模式”。

環(huán)狀 RNA 是豐富的共價閉合轉錄本，通過反向剪接在細胞中產(chǎn)生，并在細胞和發(fā)育階段顯示不同的表達模式。雖然它們的功能在很大程度上是未知的，但它們內在的穩(wěn)定性使它們成為許多疾病中有價值的生物標志物。

在這項新研究中，來自美國國立衛(wèi)生研究院國家老齡化研究所、阿拉巴馬大學伯明翰分校、伯明翰退伍軍人事務醫(yī)學中心和 Cedars-Sinai 醫(yī)學中心的研究人員著手研究肌萎縮側索硬化癥(ALS) 中的 circRNA 模式。通過 RNA 測序分析，研究人員首先鑒定出 circRNA 和線性 RNA，它們在 ALS 的骨骼肌活檢組織中與正常個體相比具有不同的豐度。

“通過 RT-qPCR 分析，我們證實在 ALS 中 8 個 circRNA 顯著升高，10 個顯著減少，而由共享前體 RNA 產(chǎn)生的線性 mRNA 對應物通常沒有變化，”作者說。

這些 circRNA 中的一些在源自帶有 ALS 突變的人類誘導多能干細胞 (iPSC)的運動神經(jīng)元中，以及來自 ALS 小鼠模型 (SOD1G93A) 的骨骼肌的不同疾病階段中也存在差異豐富。有趣的是，在 ALS 患者和 ALS (SOD1G93A) 小鼠的脊髓樣本中，一部分在 ALS 肌肉活檢中顯著升高的 circRNA 子集顯著減少。總之，研究人員在 ALS 相關組織(肌肉和脊髓)中發(fā)現(xiàn)了差異豐富的 circRNA，這些 circRNA 可以告知 ALS 中的神經(jīng)肌肉分子程序并指導療法的開發(fā)。

研究人員總結說：“隨著我們研究的推進，我們將研究本文報道的 18 種 circRNA 中最有前途和最豐富的 circRNA 的功能。我們對那些似乎對 ALS 具有特異性的那些特別感興趣，因為它們可能有助于表征可以作為治療目標的疾病相關分子通路。”

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